un seul gène vous manque et les ailes sont atrophiées

Test du moment : que ce passe-t-il lorsque j'enlève un gène particulier (chut ! ces choses là ne se disent pas) spécifiquement dans l'aile ? Et ben il n'y en a plus, ou presque !
Bien sûr, la mouche sauvage est à gauche et la mutante est à droite... mais est-ce utile de le préciser ?

t'as de beaux yeux...

Je m'essaye au phénotypage : effet de l'extinction génique d'une protéine sur la morphologie de l'oeil. Les essais ne sont pas très concluant et je vais passer à une extinction ciblée dans l'aile car ce sera plus sensible. Mais j'ai quand même pu m'amuser un peu avec des mouches et leur tirer le portrait !

professeur maboul

Vendredi, c'est pleine de bonnes intention que je décide de refaire du tampon de Laemlli pour l'équipe. Le laemlli est encore appelé bleu de charge. Le mien était... jaune !?

Et quand Cathy arrive, qu'elle me voit assise à la paillasse et me demande ce que je fais, je ne trouve bien sûr rien de mieux à lui dire que "j'attends que ça vire au bleu ; ça met longtemps à changer de couleur quand tu le prépares, le Laemlli ?" "ben non, il est de suite bleu, mais là, c'est très jaune, ton truc !".
Mais maintenant j'ai compris l'erreur : pour faire du Laemlli, il faut prendre du SDS en poudre et ne pas utiliser la solution liquide à 20% commerciale ! Lundi, je remets ça !

artistique

Rien que pour ça, j'adore la microscopie !

RVB

Bientôt les vacances. Repos mérité. Mes premières vacances dans mon nouveau statu de thésarde. Petit retour sur mes premiers mois de jeune chercheuse...

Un démarrage tranquille. Pas trop de pression. Je me refamiliarise avec mes manipes en cellules et j'apprends à manier mon nouveau joujou : les drosophiles. Débuts chaotiques, des larves trop petites pour mes pinces qui semblent trop grosses. On patiente, on s'accroche, on essaye, encore et enfin, ça marche. Une bonne moyenne de 25-30 larves par heures.

Mais à la rentrée, il va falloir accélérer le rythme pour "vite publier les résultats en cellules humaines". Je vais faire mon possible, mais je ne suis pas encore Shiva. L'ordre des manipes est bien assimilé, ne reste plus qu'à les faire. Peut être que je vais laisser un peu de côté la droso pendant un moment en janvier pour avancer un max sur les fameuses cellules humaines... Je pense que passer le deuxième week-end de janvier (celui du 8 janvier), je vais prendre des HNO tous les week-end pour avancer un max. Ce qui n'est pas cool, avec ce principe, c'est que les chefs ne sont pas là pour se rendre compte du travail fourni, et qu'au final, ils ne voient que le résultat... Mais bon, il me faut au moins un article en premier auteur pour pouvoir soutenir dans 3 ans, et comme nous l'a si bien dit notre directeur de l'Ecole Doctorale "n'attendez pas la troisième année pour publier !". Facile à dire...
En attendant, les derniers jours au labo avant les vacances seront bien calmes. 

Une de mes jolies acquisitions sur cellules du corps gras larvaire

c'est pas sorcier

Première dissection de larve de drosophile. Je m'en faisais une montagne. Finalement, ce n'était qu'une colline qui devrait devenir une plaine avec la pratique...

Seulement 3 conditions de croisement disséquées entre jeudi et vendredi ; j'espère faire les 6 restantes lundi...

Une de mes acquisitions 
(rouge : actine, vert : protéine en fusion avec la GFP, bleu : noyau)

jargon drosophiliste

- Comment je mets mets ma lignée à l'homozygote ?

- Tu prends des femelles aux yeux bien rouges et tu croises avec une souche balancée avec Curly et dans la F2 tu récupéreras les mouches Curly...

- If n'est pas un balanceur ?

- Non parce que si c'était le cas, If/Curly serait létal

- Les pauvres...

- Après ton croisement, tu dissèqueras le corps gras des L3 (heureusement que je sais que L3 signifie "feading larvae")

- C'est quoi les mouches Hu ?

- Celles qui ont le balanceur Huméral. (je suis bien avancée ! -.-")

vise la Lune, au pire tu toucheras les étoiles

Parfois, il faut rêver. Rêver que tout peut bien se passer. Rêver qu'on peut faire de grandes choses. Certains diront que c'est de l'utopie. Je me dis que c'est l'Espoir, avec un grand "E".

Une envie. Celle d'aller vite. Vite et bien. Mener à bien son rêve, son utopie, son Espoir pour enfin sortir du rêve, se réveiller, entrer dans la réalité. On commence petit, on espère finir grand. Je pars de peu, j'espère aller loin, gravir mon Everest.

Vise la Lune, au pire tu toucheras les étoiles, F. Dubosc

J'ai entendu cette citation par hasard, l'autre soir alors que je zappais devant le vide intersidéral de la télévision. Je suis tombée sur une émission moins pire, peut être, que les autres, et moins démoralisante que les émissions d'Arte sur les guerres et autres faits tristement célèbres de notre actualité, présente et surtout passée. Bref, je tombe sur cette émission, il y a des chansons et Frank Dubosc. Cette métaphore m'a parue jolie et absurde aussi, un peu. Les étoiles sont plus loin que la Lune. Mais ce n'est pas grave, c'est l'idée qui compte, sa poésie.

Ces quelques mots ont commencé à sonner dans mon esprit tels un leimotiv.

Ma Lune, c'est de faire avancer la recherche. Et j'ai atteint ma première étoile. Les travaux auxquels j'ai apporté ma contribution, mes petites mains de débutante, un certain été 2008 vont être publier. L'article a été accepté dans FEBS letters. Et j'attends le scintillement de cette première petite étoile.

Je me lance à l'assaut de la suivante...

Groupe d'étoiles (source : HubbleSite)

la mitose vue de près

J'ai découvert la microscopie, et je trouve ça magique. On est au plus près de nos cellules. Nos petites "ouvrières"... Je suis loin d'être une pro, et le logiciel du confocal a encore de nombreux secrets à me révéler. Mais je progresse, petit à petit.

Ci-après, quelques acquisitions que j'ai faites, pour m'amuser. Des grossissements sur les jolies phases de mitose. L'ADN est en bleu (Hoechst) et en vert, il s'agit d'un marquage des facteurs NF-kappaB.

pix' 1 : métaphase

pix' 2 : anaphase

au coeur de la fission cellulaire

Après "cherchez Charlie", voici "cherchez les mitoses" :)

Je me suis mise à la microscopie confocale avec mes cellules humaines (pas les miennes, enfin les mienne qui ne sont pas à moi...). Et j'ai eu la chance de voir quelques jolies mitoses. Ce champ en possèdent plusieurs, saurez-vous les retrouver et les nommer ? 

pix' : noyaux de cellules HEK93T coloré au Hoechst

Je suis désolée pour la mauvaise qualité, mon image est saturée en Hoechst par endroit, mais c'est ma lame qui devait avoir un défaut :s

phototropisme, ou "on s'amuse comme on peut"

Aujourd'hui. Dimanche 11 avril 2010. Je fais un peu de ménage, parce qu'il faut. Mais comme cela m'ennuie, je m'empresse de trouver une autre activité, bien plus ludique :) L'idée m'est venue lorsque mon regard est tombé sur mes futurs malheureux petits plants de persil (si si, je fais pousser du persil ! et du basilic aussi). Tous alignés, saluant la fenêtre. Ben oui, c'est de là que vient la lumière ! Je me suis dit ,alors, que j'allais leur donner le torticolis :) Je donc tourné le pot de 180° pour que les petits plants se retrouvent tournés vers l'intérieur de la pièce. Puis j'ai attendu et ai pris des photos de temps en temps.
C'est alors que j'ai fait LA découverte du siècle ! Les petits plants se sont réorientés progressivement (mais rapidement) vers la fenêtre ! :) Je devrais au moins avoir un prix Nobel pour cela...

pix' 1 : les petits plants quand mon regard s'est posé dessus

pix' 2 : les petits plants après leur demi-tour

pix' 3 : environ 1h30 plus tard...

pix' 4 : encore 1h après :)

Et dire qu'il y a des élèves qui ne parviennent pas à trouver un TPE qui tienne la route ! Moi je l'ai mis au point en quelques heures à peine.
Je n'ai qu'un conseil à leur donner : du ménage, faites, et l'inspiration sera... :)

un chercheur, c'est avant tout...

... une personne sympa qui cherche :

• comment faire 100h de boulot dans une semaine,
• comment garder le moral quand toutes les manipes foirent,
• comment expliquer à ses amis que tu ne peux toujours pas sortir ce week-end, tu vas encore le passer au labo,

Mais surtout, qui cherche :

• quoi faire de ses journées
• comment faire croire à son chef que la manipe dure 3 mois alors qu'elle dure 3 jours,
• à comprendre ses résultats,
• comment foirer "accidentellement" sa manipe pour finir plus tôt,
• à ne pas penser à ses manipes quand il est dans son lit, et à ne pas penser à son lit quand il fait ses manipes
• un moyen de faire souffrir tous ceux qui lui ont dit un jour "un chercheur ça cherche, ce qu'il faut c'est des trouveur..."
• à ne pas oublier sa langue maternelle, le français ! on ne dit pas "runer un gel", et le goat ça n'existe pas comme animal en France
• à oublier le labo à la maison : tu as un frigo et un congèle, pas un +4°C et un -20°C

à la base de tout organisme multicellulaire...

... il y a la division cellulaire !
Quelques petites vidéos obtenues en microscopie ou bien d'autres plus "cartoon", mais que j'ai trouvé plutôt pas mal...


Les commentaires sont anglais, mais franchement, c'est super simple. ;) Surtout, on voit bien le mouvement des chromosomes...


Jolies illustrations de la mitose.


Cartoon qui n'est peut être pas véritablement fidèle à la réalité (représentation de la chromatine en interphase un peu étrange, mais bon), mais qui représente cependant pas trop mal les événements.


Mitosis vs meiosis

HIV replication

Petit film d'animation sur l'infection des lymphocytes par le VIH, et son mécanisme de réplication...
Attention, en english... ;)

parce que la bio cell, c'est ça !

Un petit film d'animation réalisé par l'université d'Harvard représentant les principaux mécanismes cellulaires : synthèse protéique, transport vésiculaire, exocytose... Présentation également des compartiments cellulaires : golgi, réticulum endoplasmique...
Un film très réaliste puisque les échelles et les temps sont se rapproche de la réalité.
Un petit plaisir des yeux... ;)