samedi 28 juin 2008

stage1... semaine2...

Tout se passe toujours bien pour cette deuxième semaine de stage au CERMAV.
Cette fois, j'ai travaillé avec Sara, une danoise qui ne parle que anglais ; j'ai donc dû mettre à rude épreuve mon anglais très élaboré ! :) Non, en fait, tout c'est très bien passé, et je me suis rendue compte que l'on se comprend pas trop mal en fait... ;) Nous avons travaillé sur la caractérisation de glycosyltransférases qui interviennent dans la synthèse de la paroi végétale.

Malheureusement, si une partie des manipes qu'on a faites étaient concluantes, pour une grande partie, c'est même pas que ce n'était pas très concluant, c'est que l'on n'a carrément pas de résultat ! :( Du coup, lundi et mardi, avec Valérie (Sara sera en rédaction d'une publi, donc c'est Valérie qui reprend les manipes), on va tout reprendre à zéro, tester d'autres colonne de purification, prendre une autre fucosyltransférase comme modèle... En espérant que cette fois-ci, on trouve quelque chose qui fonctionne... :)

Sinon, toujours une très bonne ambiance : jeudi soir, apéro entre stagiaires et doctorants, et vendredi midi, méchoui ! Sur la terrasse, devant le CERMAV, super ! ;) Comme dit papa : "je vois que ça bosse dur !"... Ben, oui... Bah, c'est pas parce qu'on prend quelques bons moments que l'on ne bosse pas, après tout, l'apéro de jeudi, c'était le soir, quand on n'avait tous fini notre journée, et le méchoui, c'était pour "le grand ménage" des étages 1 et 3 (donc, l'équipe Glycobiologie moléculaire n'était pas concernée)... Et puis, d'abord... je n'ai pas à me justifier ! Na ! :p

Au fait, encore une chose... Lundi matin, j'ai repassé l'examen de Physiologie des grandes fonctions, et je crois que ça a plutôt bien marché ! :)
Maintenant, j'attend avec impatience les résultats, qui doivent tomber le 17 juillet, d'après ce que m'a dit la secrétaire à l'UFR de Biologie...

chacun cherche son chat


J'ai perdu mon Bali ce matin... mais, ouf ! je l'ai retrouvé, ou plutôt, il m'a retrouvé !
Ce matin, j'ai aéré l'appart', mais sans garder un oeil sur le fÔve ! Et quand j'ai levé les yeux des papiers que j'étais en train de classer, plus de chat ! La panique !!!! :(
Il a du tomber du balcon, ou sauter, je ne sais pas... Toujours est-il que je l'ai cherché partout, chez les voisins, dans la rue... en vain...
Quand d'un coup, au bord du désespoir, un "miaou" strident arrive à mes oreilles, mon Bali était tout recroqueviller sous une voiture, il a courru vers moi en rasant le sol, et on est rentré à la maison !
OUF ! Ca fini bien ! :) Je ferai plus attention maintenant... ;)

dimanche 22 juin 2008

stage1... semaine1...

Le grand saut !
J'ai commencé mon premier stage en laboratoire de recherche ce lundi, et jusque là, j'en suis ravie ! Pendant un mois, soit du 16 juin au 15 juillet environ, je vais m'initier à la recherche fondamentale en biologie au CERMAV (Centre de Recherche sur les Macromolécules Végétales), dans l'équipe de "Glycobiologie moléculaire" sous la houlette du Professeur Christelle Breton. Enseignante que j'ai déjà croisé à mainte reprise dans mes cours magistraux depuis la première année de licence jusqu'à ma L3, et que je recroiserai probablement encore en master. Son domaine ? La glycosylation, c'est-à-dire le transfert de sucres (mannose, glucose, galactose) sur les protéines ou les lipides pour en faire ce que l'on appelle couramment des "glycoconjugués"... Si vous n'êtes pas du domaine de la biologie, je dois probablement vous parler chinois, mais bon...

Bref... Durant cette première semaine, j'ai accompagné Emilie, une étudiante en 3ème année de thèse. Son sujet : l'étude d'une lectine de la bactérie pathogène Burkholderia cenocepacia qui affecte notamment les malades de la mucoviscidose. Pourquoi étudier cette lectine ? Parce qu'elle intervient dans l'accrochage de la bactérie aux cellules des muqueuses. Le but est donc de caractériser cette (ces ?) lectine pour pouvoir, par la suite, mettre au point des traitements qui empêcheraient la méchante Burkholderia de se fixer sur les pauvres petites cellules du malades.
Donc, au programme cette semaine :
  • mise en culture de bactéries (la fidèle Escherichia coli) recombinantes, c'est-à-dire qu'elles exprime notre protéine qu'elles n'expriment pas normalement (donc ici la partie N-terminale de la lectine, à laquelle est en plus ajoutée une étiquette poly-histidine) ;
  • lyse des cellules pour en récupérer les protéines à l'aide d'un "broyeur de cellules" qui fonctionne en faisant varier la pression ;
  • séparation et récupération de notre protéine par gel filtration sur une colonne de Ni-NTA (une matrice qui fixe les histidines que nous avons ajoutées à notre protéine) ;
  • gel SDS-PAGE pour s'assurer qu'on a bien récupéré notre protéine et qu'elle est pure.
En gros, la routine... Mais pour l'instant, cette "routine" me plait bien ;) J'ai même déjà commencé à rédiger mon rapport de stage !

En parallèle de cette première semaine de stage, j'ai aussi fait mes révisions pour les rattrapages, puisque j'ai choisi d'aller en 2ème session pour le dernier semestre de licence... :(
Vendredi matin, j'ai passé la biologie structurale (que j'ai joyeusement surnommée durant tout le semestre "bio naze"), et je crois que ça s'est bien passé, en tout cas, j'étais vraiment satisfaite de moi en sortant de l'examen ;) Et j'espère que je ne serai pas déçue par le résultat, comme ce fut le cas pour la 1ère session...
Et lundi (23 juin), je remet ça ! Je repasse la physiologie des grandes fonctions, en priant que ça tombe sur la respiration et surtout pas sur le cours de Saks sur la circulation !!! :(
Je ne sais même pas quand seront les résultats de la 2ème session, ni quand est-ce que je pourrai récupérer mon attestation de licence...

Et j'attend encore et toujours ma convention pour ce stage au CERMAV !

nouveau départ...

L'ancien blog vient de passer la barre des 1 an (ouvert le 1er juin 2007), et beaucoup d'articles en vrac (quelques 125 articles)...
Donc voilà, envie de changer, envie de quelque chose de neuf, alors je déménage ! Non pas physiquement, mais "virtuellement" avec ce nouveau blog "parce qu'il y a des jours comme ça...". Je prend alors un nouveau chemin sur la jungle du net, qui lui, semble loin d'être touché par le réchauffement climatique, loin de la sécheresse grimpante...
Bref... trêve d'écologie, je laisse cela à d'autre ! ;)

Pour ceux qui voudraient retrouver l'ancien blog
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Après streptomyces, voici interleukine... bah, tant qu'à faire, autant rester dans la bio, et puis, j'A-D-O-R-E l'immunologie ! Vous savez, la branche de la biologie qui étudie l'immunité, les anticorps, les globules blancs, les vilaines petites bactéries qui nous rendent malades... Enfin, vous voyez, quoi ?!

Ici, dans ce nouveau blog, je vais essayer de me disperser un peu moins (quoi que... plus facile à dire qu'à faire...). Je tacherai de passer par là de manière quelque peu plus assidue ;)
Après, sinon, pas beaucoup de différence avec l'ancien... Moi, mon n'Amour, mes potes, mon fÔve, la fac... Mes coups de gueule et mes coups de pas gueule... ;) Enfin, moi quoi ! Parce que je suis juste moi... finalement...!!!